Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDEM3Q9BZQ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
EDEM3Q9BZQ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDEM3Q9BZQ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDEM3Q9BZQ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDEM3Q9BZQ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDEM3Q9BZQ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDEM3Q9BZQ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDEM3Q9BZQ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDEM3Q9BZQ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDEM3Q9BZQ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EDEM3Q9BZQ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDEM3Q9BZQ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EDEM3Q9BZQ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDEM3Q9BZQ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDEM3Q9BZQ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EDEM3Q9BZQ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDEM3Q9BZQ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDEM3Q9BZQ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EDEM3Q9BZQ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDEM3Q9BZQ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDEM3Q9BZQ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDEM3Q9BZQ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDEM3Q9BZQ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDEM3Q9BZQ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDEM3Q9BZQ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDEM3Q9BZQ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EDEM3Q9BZQ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms