Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPO3Q9BXY4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPO3Q9BXY4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPO3Q9BXY4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO3Q9BXY4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO3Q9BXY4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO3Q9BXY4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO3Q9BXY4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO3Q9BXY4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RSPO3Q9BXY4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RSPO3Q9BXY4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RSPO3Q9BXY4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPO3Q9BXY4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RSPO3Q9BXY4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms