Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALN1Q9BXU9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALN1Q9BXU9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALN1Q9BXU9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALN1Q9BXU9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALN1Q9BXU9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CALN1Q9BXU9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms