Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG6Q9BXT2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG6Q9BXT2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG6Q9BXT2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG6Q9BXT2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG6Q9BXT2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG6Q9BXT2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG6Q9BXT2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG6Q9BXT2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG6Q9BXT2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG6Q9BXT2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG6Q9BXT2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG6Q9BXT2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG6Q9BXT2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNG6Q9BXT2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNG6Q9BXT2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNG6Q9BXT2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms