Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHF7Q9BWX1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHF7Q9BWX1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PHF7Q9BWX1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHF7Q9BWX1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHF7Q9BWX1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF7Q9BWX1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF7Q9BWX1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF7Q9BWX1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHF7Q9BWX1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PHF7Q9BWX1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHF7Q9BWX1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF7Q9BWX1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF7Q9BWX1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHF7Q9BWX1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF7Q9BWX1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF7Q9BWX1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHF7Q9BWX1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PHF7Q9BWX1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHF7Q9BWX1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHF7Q9BWX1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PHF7Q9BWX1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF7Q9BWX1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF7Q9BWX1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF7Q9BWX1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHF7Q9BWX1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHF7Q9BWX1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHF7Q9BWX1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF7Q9BWX1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF7Q9BWX1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF7Q9BWX1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF7Q9BWX1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PHF7Q9BWX1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PHF7Q9BWX1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHF7Q9BWX1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF7Q9BWX1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHF7Q9BWX1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF7Q9BWX1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF7Q9BWX1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF7Q9BWX1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PHF7Q9BWX1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF7Q9BWX1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PHF7Q9BWX1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PHF7Q9BWX1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PHF7Q9BWX1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PHF7Q9BWX1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF7Q9BWX1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF7Q9BWX1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF7Q9BWX1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF7Q9BWX1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF7Q9BWX1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF7Q9BWX1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF7Q9BWX1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF7Q9BWX1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF7Q9BWX1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF7Q9BWX1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHF7Q9BWX1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHF7Q9BWX1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF7Q9BWX1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF7Q9BWX1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF7Q9BWX1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF7Q9BWX1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF7Q9BWX1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF7Q9BWX1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF7Q9BWX1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF7Q9BWX1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF7Q9BWX1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF7Q9BWX1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF7Q9BWX1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF7Q9BWX1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF7Q9BWX1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF7Q9BWX1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF7Q9BWX1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF7Q9BWX1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF7Q9BWX1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF7Q9BWX1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF7Q9BWX1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF7Q9BWX1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF7Q9BWX1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms