Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSBP3Q9BWW4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSBP3Q9BWW4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSBP3Q9BWW4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SSBP3Q9BWW4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSBP3Q9BWW4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSBP3Q9BWW4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSBP3Q9BWW4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSBP3Q9BWW4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSBP3Q9BWW4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSBP3Q9BWW4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSBP3Q9BWW4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSBP3Q9BWW4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSBP3Q9BWW4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSBP3Q9BWW4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSBP3Q9BWW4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSBP3Q9BWW4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSBP3Q9BWW4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSBP3Q9BWW4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms