Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM2Q9BVW6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM2Q9BVW6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMIM2Q9BVW6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms