Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM62Q9BVG3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM62Q9BVG3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM62Q9BVG3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM62Q9BVG3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM62Q9BVG3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM62Q9BVG3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM62Q9BVG3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM62Q9BVG3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM62Q9BVG3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM62Q9BVG3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM62Q9BVG3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM62Q9BVG3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM62Q9BVG3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM62Q9BVG3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM62Q9BVG3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM62Q9BVG3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM62Q9BVG3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM62Q9BVG3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM62Q9BVG3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM62Q9BVG3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM62Q9BVG3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM62Q9BVG3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM62Q9BVG3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM62Q9BVG3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM62Q9BVG3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM62Q9BVG3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM62Q9BVG3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM62Q9BVG3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRIM62Q9BVG3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM62Q9BVG3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM62Q9BVG3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM62Q9BVG3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM62Q9BVG3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM62Q9BVG3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM62Q9BVG3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM62Q9BVG3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM62Q9BVG3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM62Q9BVG3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM62Q9BVG3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM62Q9BVG3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM62Q9BVG3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM62Q9BVG3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM62Q9BVG3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM62Q9BVG3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms