Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU79

TMEM243, Transmembrane protein 243, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM243Q9BU79 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM243Q9BU79 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM243Q9BU79 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM243Q9BU79 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM243Q9BU79 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM243Q9BU79 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM243Q9BU79 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM243Q9BU79 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM243Q9BU79 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM243Q9BU79 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM243Q9BU79 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM243Q9BU79 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM243Q9BU79 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM243Q9BU79 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM243Q9BU79 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM243Q9BU79 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM243Q9BU79 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM243Q9BU79 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms