Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRFN3Q9BTN0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRFN3Q9BTN0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRFN3Q9BTN0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRFN3Q9BTN0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRFN3Q9BTN0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRFN3Q9BTN0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRFN3Q9BTN0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRFN3Q9BTN0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRFN3Q9BTN0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRFN3Q9BTN0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRFN3Q9BTN0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRFN3Q9BTN0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRFN3Q9BTN0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRFN3Q9BTN0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRFN3Q9BTN0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRFN3Q9BTN0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRFN3Q9BTN0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRFN3Q9BTN0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRFN3Q9BTN0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRFN3Q9BTN0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRFN3Q9BTN0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRFN3Q9BTN0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRFN3Q9BTN0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRFN3Q9BTN0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRFN3Q9BTN0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRFN3Q9BTN0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRFN3Q9BTN0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRFN3Q9BTN0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRFN3Q9BTN0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRFN3Q9BTN0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRFN3Q9BTN0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRFN3Q9BTN0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRFN3Q9BTN0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRFN3Q9BTN0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRFN3Q9BTN0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRFN3Q9BTN0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRFN3Q9BTN0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRFN3Q9BTN0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRFN3Q9BTN0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRFN3Q9BTN0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRFN3Q9BTN0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRFN3Q9BTN0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRFN3Q9BTN0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRFN3Q9BTN0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRFN3Q9BTN0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRFN3Q9BTN0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRFN3Q9BTN0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRFN3Q9BTN0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRFN3Q9BTN0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRFN3Q9BTN0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRFN3Q9BTN0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LRFN3Q9BTN0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRFN3Q9BTN0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRFN3Q9BTN0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRFN3Q9BTN0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRFN3Q9BTN0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRFN3Q9BTN0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRFN3Q9BTN0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRFN3Q9BTN0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRFN3Q9BTN0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRFN3Q9BTN0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRFN3Q9BTN0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRFN3Q9BTN0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRFN3Q9BTN0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRFN3Q9BTN0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRFN3Q9BTN0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRFN3Q9BTN0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRFN3Q9BTN0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRFN3Q9BTN0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRFN3Q9BTN0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRFN3Q9BTN0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRFN3Q9BTN0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRFN3Q9BTN0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRFN3Q9BTN0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRFN3Q9BTN0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRFN3Q9BTN0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRFN3Q9BTN0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRFN3Q9BTN0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRFN3Q9BTN0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRFN3Q9BTN0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRFN3Q9BTN0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRFN3Q9BTN0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LRFN3Q9BTN0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms