Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHANK2-AS3Q9BTD1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHANK2-AS3Q9BTD1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SHANK2-AS3Q9BTD1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.6 ms