Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SYT17Q9BSW7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SYT17Q9BSW7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SYT17Q9BSW7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SYT17Q9BSW7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SYT17Q9BSW7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SYT17Q9BSW7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SYT17Q9BSW7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
SYT17Q9BSW7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SYT17Q9BSW7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.77■■■■□ 3
SYT17Q9BSW7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SYT17Q9BSW7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYT17Q9BSW7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYT17Q9BSW7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYT17Q9BSW7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYT17Q9BSW7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYT17Q9BSW7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYT17Q9BSW7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYT17Q9BSW7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYT17Q9BSW7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYT17Q9BSW7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYT17Q9BSW7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYT17Q9BSW7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYT17Q9BSW7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYT17Q9BSW7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYT17Q9BSW7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYT17Q9BSW7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYT17Q9BSW7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYT17Q9BSW7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SYT17Q9BSW7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYT17Q9BSW7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYT17Q9BSW7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SYT17Q9BSW7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYT17Q9BSW7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYT17Q9BSW7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYT17Q9BSW7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYT17Q9BSW7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYT17Q9BSW7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYT17Q9BSW7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYT17Q9BSW7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYT17Q9BSW7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYT17Q9BSW7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYT17Q9BSW7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYT17Q9BSW7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYT17Q9BSW7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYT17Q9BSW7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYT17Q9BSW7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SYT17Q9BSW7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYT17Q9BSW7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SYT17Q9BSW7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYT17Q9BSW7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYT17Q9BSW7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SYT17Q9BSW7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SYT17Q9BSW7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYT17Q9BSW7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYT17Q9BSW7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYT17Q9BSW7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYT17Q9BSW7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SYT17Q9BSW7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYT17Q9BSW7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYT17Q9BSW7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SYT17Q9BSW7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SYT17Q9BSW7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYT17Q9BSW7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYT17Q9BSW7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SYT17Q9BSW7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYT17Q9BSW7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYT17Q9BSW7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SYT17Q9BSW7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYT17Q9BSW7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SYT17Q9BSW7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYT17Q9BSW7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SYT17Q9BSW7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SYT17Q9BSW7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SYT17Q9BSW7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SYT17Q9BSW7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
SYT17Q9BSW7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYT17Q9BSW7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYT17Q9BSW7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYT17Q9BSW7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYT17Q9BSW7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYT17Q9BSW7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYT17Q9BSW7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYT17Q9BSW7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYT17Q9BSW7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYT17Q9BSW7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SYT17Q9BSW7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYT17Q9BSW7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SYT17Q9BSW7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYT17Q9BSW7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYT17Q9BSW7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms