Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINS3Q9BRX5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GINS3Q9BRX5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GINS3Q9BRX5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GINS3Q9BRX5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GINS3Q9BRX5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GINS3Q9BRX5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms