Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC22CQ9BRL7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22CQ9BRL7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC22CQ9BRL7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC22CQ9BRL7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEC22CQ9BRL7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms