Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SRSF8Q9BRL6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SRSF8Q9BRL6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF8Q9BRL6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRSF8Q9BRL6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRSF8Q9BRL6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms