Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPPED1Q9BRF8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPPED1Q9BRF8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CPPED1Q9BRF8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CPPED1Q9BRF8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CPPED1Q9BRF8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPPED1Q9BRF8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPPED1Q9BRF8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CPPED1Q9BRF8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPPED1Q9BRF8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPPED1Q9BRF8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CPPED1Q9BRF8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPPED1Q9BRF8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CPPED1Q9BRF8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CPPED1Q9BRF8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CPPED1Q9BRF8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CPPED1Q9BRF8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPPED1Q9BRF8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPPED1Q9BRF8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPPED1Q9BRF8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPPED1Q9BRF8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPPED1Q9BRF8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPPED1Q9BRF8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPPED1Q9BRF8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPPED1Q9BRF8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPPED1Q9BRF8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPPED1Q9BRF8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPPED1Q9BRF8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPPED1Q9BRF8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CPPED1Q9BRF8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPPED1Q9BRF8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms