Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR61

ACBD6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD6Q9BR61 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACBD6Q9BR61 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACBD6Q9BR61 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACBD6Q9BR61 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ACBD6Q9BR61 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACBD6Q9BR61 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACBD6Q9BR61 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACBD6Q9BR61 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ACBD6Q9BR61 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACBD6Q9BR61 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACBD6Q9BR61 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACBD6Q9BR61 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACBD6Q9BR61 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACBD6Q9BR61 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACBD6Q9BR61 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACBD6Q9BR61 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACBD6Q9BR61 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACBD6Q9BR61 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACBD6Q9BR61 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACBD6Q9BR61 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACBD6Q9BR61 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACBD6Q9BR61 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACBD6Q9BR61 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ACBD6Q9BR61 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ACBD6Q9BR61 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACBD6Q9BR61 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACBD6Q9BR61 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACBD6Q9BR61 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACBD6Q9BR61 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACBD6Q9BR61 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACBD6Q9BR61 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACBD6Q9BR61 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACBD6Q9BR61 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACBD6Q9BR61 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACBD6Q9BR61 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACBD6Q9BR61 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACBD6Q9BR61 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACBD6Q9BR61 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ACBD6Q9BR61 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ACBD6Q9BR61 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ACBD6Q9BR61 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ACBD6Q9BR61 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACBD6Q9BR61 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACBD6Q9BR61 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACBD6Q9BR61 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ACBD6Q9BR61 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ACBD6Q9BR61 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACBD6Q9BR61 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ACBD6Q9BR61 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACBD6Q9BR61 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACBD6Q9BR61 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACBD6Q9BR61 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACBD6Q9BR61 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms