Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
FYCO1Q9BQS8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
FYCO1Q9BQS8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
FYCO1Q9BQS8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
FYCO1Q9BQS8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
FYCO1Q9BQS8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
FYCO1Q9BQS8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
FYCO1Q9BQS8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
FYCO1Q9BQS8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
FYCO1Q9BQS8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
FYCO1Q9BQS8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
FYCO1Q9BQS8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
FYCO1Q9BQS8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
FYCO1Q9BQS8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
FYCO1Q9BQS8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
FYCO1Q9BQS8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
FYCO1Q9BQS8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
FYCO1Q9BQS8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
FYCO1Q9BQS8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
FYCO1Q9BQS8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
FYCO1Q9BQS8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
FYCO1Q9BQS8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
FYCO1Q9BQS8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
FYCO1Q9BQS8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.56■■■■■ 4.24
FYCO1Q9BQS8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
FYCO1Q9BQS8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
FYCO1Q9BQS8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
FYCO1Q9BQS8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.53■■■■■ 4.24
FYCO1Q9BQS8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
FYCO1Q9BQS8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
FYCO1Q9BQS8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
FYCO1Q9BQS8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
FYCO1Q9BQS8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
FYCO1Q9BQS8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
FYCO1Q9BQS8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
FYCO1Q9BQS8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
FYCO1Q9BQS8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
FYCO1Q9BQS8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
FYCO1Q9BQS8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
FYCO1Q9BQS8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
FYCO1Q9BQS8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
FYCO1Q9BQS8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
FYCO1Q9BQS8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
FYCO1Q9BQS8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
FYCO1Q9BQS8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
FYCO1Q9BQS8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
FYCO1Q9BQS8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
FYCO1Q9BQS8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
FYCO1Q9BQS8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
FYCO1Q9BQS8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
FYCO1Q9BQS8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
FYCO1Q9BQS8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
FYCO1Q9BQS8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
FYCO1Q9BQS8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
FYCO1Q9BQS8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC41.38■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
FYCO1Q9BQS8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
FYCO1Q9BQS8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
FYCO1Q9BQS8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.3■■■■■ 4.2
FYCO1Q9BQS8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
FYCO1Q9BQS8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
FYCO1Q9BQS8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
FYCO1Q9BQS8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
FYCO1Q9BQS8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
FYCO1Q9BQS8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
FYCO1Q9BQS8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
FYCO1Q9BQS8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
FYCO1Q9BQS8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
FYCO1Q9BQS8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
FYCO1Q9BQS8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
FYCO1Q9BQS8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
FYCO1Q9BQS8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
FYCO1Q9BQS8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
FYCO1Q9BQS8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
FYCO1Q9BQS8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
FYCO1Q9BQS8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
FYCO1Q9BQS8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
FYCO1Q9BQS8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
FYCO1Q9BQS8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
FYCO1Q9BQS8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms