Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BPIFA3Q9BQP9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BPIFA3Q9BQP9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BPIFA3Q9BQP9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BPIFA3Q9BQP9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BPIFA3Q9BQP9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BPIFA3Q9BQP9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BPIFA3Q9BQP9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BPIFA3Q9BQP9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BPIFA3Q9BQP9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BPIFA3Q9BQP9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BPIFA3Q9BQP9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BPIFA3Q9BQP9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BPIFA3Q9BQP9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BPIFA3Q9BQP9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BPIFA3Q9BQP9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BPIFA3Q9BQP9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BPIFA3Q9BQP9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BPIFA3Q9BQP9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BPIFA3Q9BQP9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BPIFA3Q9BQP9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BPIFA3Q9BQP9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BPIFA3Q9BQP9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BPIFA3Q9BQP9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BPIFA3Q9BQP9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BPIFA3Q9BQP9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BPIFA3Q9BQP9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BPIFA3Q9BQP9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BPIFA3Q9BQP9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BPIFA3Q9BQP9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
BPIFA3Q9BQP9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
BPIFA3Q9BQP9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BPIFA3Q9BQP9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BPIFA3Q9BQP9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BPIFA3Q9BQP9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BPIFA3Q9BQP9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BPIFA3Q9BQP9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BPIFA3Q9BQP9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BPIFA3Q9BQP9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BPIFA3Q9BQP9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BPIFA3Q9BQP9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BPIFA3Q9BQP9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BPIFA3Q9BQP9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BPIFA3Q9BQP9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BPIFA3Q9BQP9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BPIFA3Q9BQP9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BPIFA3Q9BQP9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BPIFA3Q9BQP9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BPIFA3Q9BQP9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BPIFA3Q9BQP9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BPIFA3Q9BQP9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BPIFA3Q9BQP9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BPIFA3Q9BQP9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BPIFA3Q9BQP9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BPIFA3Q9BQP9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BPIFA3Q9BQP9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BPIFA3Q9BQP9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms