Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPOCK3Q9BQ16 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPOCK3Q9BQ16 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPOCK3Q9BQ16 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCK3Q9BQ16 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPOCK3Q9BQ16 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPOCK3Q9BQ16 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCK3Q9BQ16 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPOCK3Q9BQ16 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPOCK3Q9BQ16 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPOCK3Q9BQ16 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPOCK3Q9BQ16 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPOCK3Q9BQ16 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCK3Q9BQ16 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCK3Q9BQ16 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCK3Q9BQ16 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCK3Q9BQ16 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPOCK3Q9BQ16 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPOCK3Q9BQ16 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPOCK3Q9BQ16 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCK3Q9BQ16 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPOCK3Q9BQ16 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPOCK3Q9BQ16 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPOCK3Q9BQ16 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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