Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clp1Q99LI9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clp1Q99LI9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clp1Q99LI9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clp1Q99LI9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clp1Q99LI9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clp1Q99LI9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clp1Q99LI9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clp1Q99LI9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clp1Q99LI9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clp1Q99LI9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Clp1Q99LI9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clp1Q99LI9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clp1Q99LI9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clp1Q99LI9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clp1Q99LI9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clp1Q99LI9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Clp1Q99LI9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clp1Q99LI9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clp1Q99LI9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Clp1Q99LI9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clp1Q99LI9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clp1Q99LI9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Clp1Q99LI9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clp1Q99LI9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clp1Q99LI9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Clp1Q99LI9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clp1Q99LI9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clp1Q99LI9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clp1Q99LI9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clp1Q99LI9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clp1Q99LI9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clp1Q99LI9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Clp1Q99LI9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clp1Q99LI9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clp1Q99LI9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Clp1Q99LI9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Clp1Q99LI9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clp1Q99LI9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clp1Q99LI9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clp1Q99LI9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Clp1Q99LI9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Clp1Q99LI9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Clp1Q99LI9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clp1Q99LI9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Clp1Q99LI9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clp1Q99LI9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Clp1Q99LI9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clp1Q99LI9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clp1Q99LI9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Clp1Q99LI9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clp1Q99LI9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clp1Q99LI9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Clp1Q99LI9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Clp1Q99LI9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clp1Q99LI9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Clp1Q99LI9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Clp1Q99LI9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Clp1Q99LI9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clp1Q99LI9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Clp1Q99LI9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Clp1Q99LI9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clp1Q99LI9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clp1Q99LI9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Clp1Q99LI9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clp1Q99LI9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clp1Q99LI9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clp1Q99LI9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clp1Q99LI9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clp1Q99LI9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clp1Q99LI9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clp1Q99LI9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clp1Q99LI9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clp1Q99LI9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clp1Q99LI9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Clp1Q99LI9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clp1Q99LI9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clp1Q99LI9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Clp1Q99LI9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clp1Q99LI9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clp1Q99LI9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clp1Q99LI9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clp1Q99LI9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Clp1Q99LI9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clp1Q99LI9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clp1Q99LI9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms