Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gps1Q99LD4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gps1Q99LD4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gps1Q99LD4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gps1Q99LD4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gps1Q99LD4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gps1Q99LD4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gps1Q99LD4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gps1Q99LD4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gps1Q99LD4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gps1Q99LD4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gps1Q99LD4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gps1Q99LD4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gps1Q99LD4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gps1Q99LD4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gps1Q99LD4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gps1Q99LD4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gps1Q99LD4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gps1Q99LD4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gps1Q99LD4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gps1Q99LD4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gps1Q99LD4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gps1Q99LD4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gps1Q99LD4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gps1Q99LD4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gps1Q99LD4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gps1Q99LD4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gps1Q99LD4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gps1Q99LD4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gps1Q99LD4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gps1Q99LD4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gps1Q99LD4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gps1Q99LD4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gps1Q99LD4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gps1Q99LD4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gps1Q99LD4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gps1Q99LD4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gps1Q99LD4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gps1Q99LD4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gps1Q99LD4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gps1Q99LD4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gps1Q99LD4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gps1Q99LD4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gps1Q99LD4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms