Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pagr1aQ99L02 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pagr1aQ99L02 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pagr1aQ99L02 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pagr1aQ99L02 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pagr1aQ99L02 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pagr1aQ99L02 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pagr1aQ99L02 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pagr1aQ99L02 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pagr1aQ99L02 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pagr1aQ99L02 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pagr1aQ99L02 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pagr1aQ99L02 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pagr1aQ99L02 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pagr1aQ99L02 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pagr1aQ99L02 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pagr1aQ99L02 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pagr1aQ99L02 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pagr1aQ99L02 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pagr1aQ99L02 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pagr1aQ99L02 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pagr1aQ99L02 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pagr1aQ99L02 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pagr1aQ99L02 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pagr1aQ99L02 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pagr1aQ99L02 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pagr1aQ99L02 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pagr1aQ99L02 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pagr1aQ99L02 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pagr1aQ99L02 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pagr1aQ99L02 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pagr1aQ99L02 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pagr1aQ99L02 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pagr1aQ99L02 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pagr1aQ99L02 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pagr1aQ99L02 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pagr1aQ99L02 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pagr1aQ99L02 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pagr1aQ99L02 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pagr1aQ99L02 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pagr1aQ99L02 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pagr1aQ99L02 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pagr1aQ99L02 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pagr1aQ99L02 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Pagr1aQ99L02 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pagr1aQ99L02 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pagr1aQ99L02 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pagr1aQ99L02 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pagr1aQ99L02 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Pagr1aQ99L02 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pagr1aQ99L02 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pagr1aQ99L02 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pagr1aQ99L02 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pagr1aQ99L02 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pagr1aQ99L02 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pagr1aQ99L02 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pagr1aQ99L02 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pagr1aQ99L02 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pagr1aQ99L02 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pagr1aQ99L02 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pagr1aQ99L02 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pagr1aQ99L02 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pagr1aQ99L02 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pagr1aQ99L02 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pagr1aQ99L02 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pagr1aQ99L02 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Pagr1aQ99L02 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pagr1aQ99L02 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pagr1aQ99L02 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pagr1aQ99L02 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms