Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ufsp2Q99K23 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ufsp2Q99K23 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufsp2Q99K23 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ufsp2Q99K23 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufsp2Q99K23 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ufsp2Q99K23 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufsp2Q99K23 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ufsp2Q99K23 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ufsp2Q99K23 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ufsp2Q99K23 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ufsp2Q99K23 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ufsp2Q99K23 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ufsp2Q99K23 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ufsp2Q99K23 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ufsp2Q99K23 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufsp2Q99K23 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufsp2Q99K23 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufsp2Q99K23 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufsp2Q99K23 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufsp2Q99K23 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufsp2Q99K23 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.2 ms