Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3GL3Q99963 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3GL3Q99963 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3GL3Q99963 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3GL3Q99963 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3GL3Q99963 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3GL3Q99963 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3GL3Q99963 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3GL3Q99963 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3GL3Q99963 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3GL3Q99963 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3GL3Q99963 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3GL3Q99963 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3GL3Q99963 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3GL3Q99963 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3GL3Q99963 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3GL3Q99963 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SH3GL3Q99963 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3GL3Q99963 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3GL3Q99963 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3GL3Q99963 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GL3Q99963 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3GL3Q99963 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3GL3Q99963 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3GL3Q99963 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3GL3Q99963 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3GL3Q99963 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3GL3Q99963 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3GL3Q99963 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3GL3Q99963 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3GL3Q99963 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3GL3Q99963 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3GL3Q99963 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms