Protein–RNA interactions for Protein: Q99929

ASCL2, Achaete-scute homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL2Q99929 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASCL2Q99929 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASCL2Q99929 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASCL2Q99929 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASCL2Q99929 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL2Q99929 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms