Protein–RNA interactions for Protein: Q99788

CMKLR1, Chemokine-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMKLR1Q99788 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMKLR1Q99788 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMKLR1Q99788 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMKLR1Q99788 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMKLR1Q99788 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CMKLR1Q99788 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CMKLR1Q99788 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMKLR1Q99788 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMKLR1Q99788 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMKLR1Q99788 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMKLR1Q99788 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMKLR1Q99788 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CMKLR1Q99788 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CMKLR1Q99788 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMKLR1Q99788 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMKLR1Q99788 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMKLR1Q99788 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMKLR1Q99788 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMKLR1Q99788 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CMKLR1Q99788 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMKLR1Q99788 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CMKLR1Q99788 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CMKLR1Q99788 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CMKLR1Q99788 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMKLR1Q99788 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms