Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CD180Q99467 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD180Q99467 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD180Q99467 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD180Q99467 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD180Q99467 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD180Q99467 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD180Q99467 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD180Q99467 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD180Q99467 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD180Q99467 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD180Q99467 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD180Q99467 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD180Q99467 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD180Q99467 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD180Q99467 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD180Q99467 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD180Q99467 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD180Q99467 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD180Q99467 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD180Q99467 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD180Q99467 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD180Q99467 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD180Q99467 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD180Q99467 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CD180Q99467 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CD180Q99467 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD180Q99467 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD180Q99467 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD180Q99467 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD180Q99467 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD180Q99467 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD180Q99467 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD180Q99467 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD180Q99467 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD180Q99467 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CD180Q99467 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD180Q99467 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD180Q99467 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD180Q99467 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD180Q99467 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD180Q99467 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD180Q99467 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CD180Q99467 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD180Q99467 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD180Q99467 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD180Q99467 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD180Q99467 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD180Q99467 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD180Q99467 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD180Q99467 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD180Q99467 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD180Q99467 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CD180Q99467 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD180Q99467 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD180Q99467 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD180Q99467 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD180Q99467 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CD180Q99467 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD180Q99467 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD180Q99467 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD180Q99467 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD180Q99467 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD180Q99467 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD180Q99467 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD180Q99467 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD180Q99467 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD180Q99467 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD180Q99467 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CD180Q99467 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD180Q99467 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD180Q99467 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD180Q99467 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD180Q99467 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CD180Q99467 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD180Q99467 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD180Q99467 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD180Q99467 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD180Q99467 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD180Q99467 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CD180Q99467 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CD180Q99467 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CD180Q99467 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD180Q99467 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD180Q99467 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD180Q99467 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD180Q99467 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CD180Q99467 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD180Q99467 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD180Q99467 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD180Q99467 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD180Q99467 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD180Q99467 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD180Q99467 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD180Q99467 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CD180Q99467 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD180Q99467 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD180Q99467 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD180Q99467 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD180Q99467 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms