Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC6Q96SB8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC6Q96SB8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC6Q96SB8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC6Q96SB8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC6Q96SB8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC6Q96SB8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC6Q96SB8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC6Q96SB8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC6Q96SB8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC6Q96SB8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC6Q96SB8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC6Q96SB8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC6Q96SB8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC6Q96SB8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC6Q96SB8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC6Q96SB8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC6Q96SB8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC6Q96SB8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC6Q96SB8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMC6Q96SB8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMC6Q96SB8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMC6Q96SB8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMC6Q96SB8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMC6Q96SB8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMC6Q96SB8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC6Q96SB8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMC6Q96SB8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC6Q96SB8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC6Q96SB8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC6Q96SB8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC6Q96SB8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC6Q96SB8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC6Q96SB8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC6Q96SB8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC6Q96SB8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMC6Q96SB8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMC6Q96SB8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMC6Q96SB8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms