Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLCC1Q96S66 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLCC1Q96S66 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLCC1Q96S66 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLCC1Q96S66 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCC1Q96S66 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCC1Q96S66 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLCC1Q96S66 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCC1Q96S66 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCC1Q96S66 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCC1Q96S66 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLCC1Q96S66 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLCC1Q96S66 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLCC1Q96S66 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCC1Q96S66 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCC1Q96S66 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCC1Q96S66 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLCC1Q96S66 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCC1Q96S66 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms