Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CRAMP1Q96RY5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CRAMP1Q96RY5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CRAMP1Q96RY5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CRAMP1Q96RY5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CRAMP1Q96RY5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CRAMP1Q96RY5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CRAMP1Q96RY5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CRAMP1Q96RY5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CRAMP1Q96RY5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CRAMP1Q96RY5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CRAMP1Q96RY5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CRAMP1Q96RY5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CRAMP1Q96RY5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CRAMP1Q96RY5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CRAMP1Q96RY5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CRAMP1Q96RY5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CRAMP1Q96RY5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CRAMP1Q96RY5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CRAMP1Q96RY5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CRAMP1Q96RY5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CRAMP1Q96RY5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CRAMP1Q96RY5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CRAMP1Q96RY5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CRAMP1Q96RY5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CRAMP1Q96RY5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CRAMP1Q96RY5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CRAMP1Q96RY5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CRAMP1Q96RY5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CRAMP1Q96RY5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CRAMP1Q96RY5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CRAMP1Q96RY5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CRAMP1Q96RY5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CRAMP1Q96RY5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CRAMP1Q96RY5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CRAMP1Q96RY5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CRAMP1Q96RY5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CRAMP1Q96RY5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CRAMP1Q96RY5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CRAMP1Q96RY5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CRAMP1Q96RY5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CRAMP1Q96RY5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CRAMP1Q96RY5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CRAMP1Q96RY5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CRAMP1Q96RY5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CRAMP1Q96RY5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CRAMP1Q96RY5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CRAMP1Q96RY5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CRAMP1Q96RY5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CRAMP1Q96RY5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CRAMP1Q96RY5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CRAMP1Q96RY5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CRAMP1Q96RY5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CRAMP1Q96RY5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms