Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BBS4Q96RK4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BBS4Q96RK4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BBS4Q96RK4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBS4Q96RK4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBS4Q96RK4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms