Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DEPDC7Q96QD5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DEPDC7Q96QD5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DEPDC7Q96QD5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DEPDC7Q96QD5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC7Q96QD5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC7Q96QD5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DEPDC7Q96QD5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DEPDC7Q96QD5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DEPDC7Q96QD5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DEPDC7Q96QD5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DEPDC7Q96QD5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DEPDC7Q96QD5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DEPDC7Q96QD5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DEPDC7Q96QD5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DEPDC7Q96QD5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DEPDC7Q96QD5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DEPDC7Q96QD5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DEPDC7Q96QD5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DEPDC7Q96QD5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEPDC7Q96QD5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEPDC7Q96QD5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEPDC7Q96QD5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DEPDC7Q96QD5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DEPDC7Q96QD5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DEPDC7Q96QD5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DEPDC7Q96QD5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DEPDC7Q96QD5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DEPDC7Q96QD5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DEPDC7Q96QD5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms