Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2CR12Q96Q35 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2CR12Q96Q35 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALS2CR12Q96Q35 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2CR12Q96Q35 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ALS2CR12Q96Q35 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALS2CR12Q96Q35 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ALS2CR12Q96Q35 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2CR12Q96Q35 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2CR12Q96Q35 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2CR12Q96Q35 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2CR12Q96Q35 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2CR12Q96Q35 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2CR12Q96Q35 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2CR12Q96Q35 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ALS2CR12Q96Q35 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALS2CR12Q96Q35 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALS2CR12Q96Q35 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ALS2CR12Q96Q35 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2CR12Q96Q35 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2CR12Q96Q35 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2CR12Q96Q35 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ALS2CR12Q96Q35 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALS2CR12Q96Q35 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALS2CR12Q96Q35 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ALS2CR12Q96Q35 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2CR12Q96Q35 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2CR12Q96Q35 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2CR12Q96Q35 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALS2CR12Q96Q35 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALS2CR12Q96Q35 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2CR12Q96Q35 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2CR12Q96Q35 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALS2CR12Q96Q35 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2CR12Q96Q35 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2CR12Q96Q35 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2CR12Q96Q35 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALS2CR12Q96Q35 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2CR12Q96Q35 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALS2CR12Q96Q35 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALS2CR12Q96Q35 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms