Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNC2Q96PR1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNC2Q96PR1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNC2Q96PR1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNC2Q96PR1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNC2Q96PR1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNC2Q96PR1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms