Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCGB3A2Q96PL1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCGB3A2Q96PL1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCGB3A2Q96PL1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCGB3A2Q96PL1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCGB3A2Q96PL1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms