Protein–RNA interactions for Protein: Q96NX9

DACH2, Dachshund homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DACH2Q96NX9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DACH2Q96NX9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DACH2Q96NX9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DACH2Q96NX9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DACH2Q96NX9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DACH2Q96NX9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms