Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU0

CNTNAP3B, Contactin-associated protein-like 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3BQ96NU0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTNAP3BQ96NU0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP3BQ96NU0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTNAP3BQ96NU0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNTNAP3BQ96NU0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTNAP3BQ96NU0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTNAP3BQ96NU0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNTNAP3BQ96NU0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP3BQ96NU0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP3BQ96NU0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTNAP3BQ96NU0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTNAP3BQ96NU0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP3BQ96NU0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTNAP3BQ96NU0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP3BQ96NU0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP3BQ96NU0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP3BQ96NU0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP3BQ96NU0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP3BQ96NU0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTNAP3BQ96NU0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTNAP3BQ96NU0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP3BQ96NU0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTNAP3BQ96NU0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTNAP3BQ96NU0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTNAP3BQ96NU0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP3BQ96NU0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP3BQ96NU0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTNAP3BQ96NU0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP3BQ96NU0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP3BQ96NU0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP3BQ96NU0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP3BQ96NU0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTNAP3BQ96NU0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTNAP3BQ96NU0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP3BQ96NU0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP3BQ96NU0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP3BQ96NU0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP3BQ96NU0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP3BQ96NU0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP3BQ96NU0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP3BQ96NU0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP3BQ96NU0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP3BQ96NU0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP3BQ96NU0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP3BQ96NU0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP3BQ96NU0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP3BQ96NU0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP3BQ96NU0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP3BQ96NU0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP3BQ96NU0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP3BQ96NU0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms