Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LINC00052Q96N35 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00052Q96N35 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00052Q96N35 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00052Q96N35 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00052Q96N35 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00052Q96N35 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms