Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC114Q96M63 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC114Q96M63 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC114Q96M63 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC114Q96M63 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC114Q96M63 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC114Q96M63 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC114Q96M63 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC114Q96M63 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC114Q96M63 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC114Q96M63 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC114Q96M63 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC114Q96M63 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC114Q96M63 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC114Q96M63 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC114Q96M63 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC114Q96M63 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC114Q96M63 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC114Q96M63 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC114Q96M63 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC114Q96M63 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC114Q96M63 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC114Q96M63 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC114Q96M63 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC114Q96M63 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC114Q96M63 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC114Q96M63 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC114Q96M63 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC114Q96M63 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC114Q96M63 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC114Q96M63 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC114Q96M63 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC114Q96M63 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms