Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNBD2Q96M20 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNBD2Q96M20 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNBD2Q96M20 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNBD2Q96M20 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD2Q96M20 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD2Q96M20 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNBD2Q96M20 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD2Q96M20 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD2Q96M20 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNBD2Q96M20 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD2Q96M20 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNBD2Q96M20 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNBD2Q96M20 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD2Q96M20 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNBD2Q96M20 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD2Q96M20 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD2Q96M20 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD2Q96M20 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNBD2Q96M20 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNBD2Q96M20 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD2Q96M20 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD2Q96M20 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNBD2Q96M20 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD2Q96M20 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNBD2Q96M20 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNBD2Q96M20 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNBD2Q96M20 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD2Q96M20 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms