Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C9orf72Q96LT7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C9orf72Q96LT7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C9orf72Q96LT7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C9orf72Q96LT7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C9orf72Q96LT7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C9orf72Q96LT7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C9orf72Q96LT7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
C9orf72Q96LT7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C9orf72Q96LT7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C9orf72Q96LT7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C9orf72Q96LT7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C9orf72Q96LT7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms