Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX22Q96L94 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX22Q96L94 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX22Q96L94 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX22Q96L94 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX22Q96L94 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms