Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHAMP1Q96JM3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CHAMP1Q96JM3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CHAMP1Q96JM3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHAMP1Q96JM3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CHAMP1Q96JM3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHAMP1Q96JM3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHAMP1Q96JM3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHAMP1Q96JM3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHAMP1Q96JM3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHAMP1Q96JM3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHAMP1Q96JM3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHAMP1Q96JM3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHAMP1Q96JM3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHAMP1Q96JM3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHAMP1Q96JM3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CHAMP1Q96JM3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHAMP1Q96JM3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHAMP1Q96JM3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHAMP1Q96JM3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHAMP1Q96JM3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHAMP1Q96JM3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHAMP1Q96JM3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHAMP1Q96JM3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHAMP1Q96JM3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHAMP1Q96JM3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHAMP1Q96JM3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHAMP1Q96JM3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHAMP1Q96JM3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHAMP1Q96JM3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CHAMP1Q96JM3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHAMP1Q96JM3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHAMP1Q96JM3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHAMP1Q96JM3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHAMP1Q96JM3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHAMP1Q96JM3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHAMP1Q96JM3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHAMP1Q96JM3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHAMP1Q96JM3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHAMP1Q96JM3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHAMP1Q96JM3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHAMP1Q96JM3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHAMP1Q96JM3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CHAMP1Q96JM3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHAMP1Q96JM3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHAMP1Q96JM3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHAMP1Q96JM3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHAMP1Q96JM3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHAMP1Q96JM3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHAMP1Q96JM3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHAMP1Q96JM3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms