Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TMX3Q96JJ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TMX3Q96JJ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
TMX3Q96JJ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TMX3Q96JJ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TMX3Q96JJ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TMX3Q96JJ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TMX3Q96JJ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TMX3Q96JJ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TMX3Q96JJ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TMX3Q96JJ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TMX3Q96JJ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TMX3Q96JJ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TMX3Q96JJ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TMX3Q96JJ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TMX3Q96JJ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TMX3Q96JJ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
TMX3Q96JJ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMX3Q96JJ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TMX3Q96JJ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMX3Q96JJ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TMX3Q96JJ7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMX3Q96JJ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMX3Q96JJ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMX3Q96JJ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TMX3Q96JJ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TMX3Q96JJ7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TMX3Q96JJ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TMX3Q96JJ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TMX3Q96JJ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TMX3Q96JJ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TMX3Q96JJ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TMX3Q96JJ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMX3Q96JJ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMX3Q96JJ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMX3Q96JJ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMX3Q96JJ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMX3Q96JJ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMX3Q96JJ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMX3Q96JJ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMX3Q96JJ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMX3Q96JJ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms