Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPD52L3Q96J77 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TPD52L3Q96J77 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPD52L3Q96J77 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPD52L3Q96J77 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPD52L3Q96J77 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPD52L3Q96J77 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPD52L3Q96J77 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPD52L3Q96J77 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPD52L3Q96J77 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPD52L3Q96J77 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPD52L3Q96J77 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPD52L3Q96J77 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPD52L3Q96J77 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPD52L3Q96J77 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPD52L3Q96J77 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPD52L3Q96J77 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPD52L3Q96J77 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPD52L3Q96J77 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPD52L3Q96J77 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPD52L3Q96J77 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPD52L3Q96J77 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPD52L3Q96J77 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPD52L3Q96J77 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPD52L3Q96J77 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPD52L3Q96J77 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPD52L3Q96J77 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPD52L3Q96J77 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPD52L3Q96J77 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPD52L3Q96J77 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPD52L3Q96J77 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPD52L3Q96J77 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms