Protein–RNA interactions for Protein: Q96HL8

SH3YL1, SH3 domain-containing YSC84-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1Q96HL8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3YL1Q96HL8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH3YL1Q96HL8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3YL1Q96HL8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3YL1Q96HL8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms