Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A3Q96HJ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MS4A3Q96HJ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A3Q96HJ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A3Q96HJ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A3Q96HJ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms