Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALML4Q96GE6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALML4Q96GE6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CALML4Q96GE6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CALML4Q96GE6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CALML4Q96GE6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CALML4Q96GE6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALML4Q96GE6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALML4Q96GE6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALML4Q96GE6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CALML4Q96GE6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CALML4Q96GE6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CALML4Q96GE6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CALML4Q96GE6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CALML4Q96GE6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CALML4Q96GE6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CALML4Q96GE6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CALML4Q96GE6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CALML4Q96GE6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CALML4Q96GE6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CALML4Q96GE6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CALML4Q96GE6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CALML4Q96GE6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CALML4Q96GE6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALML4Q96GE6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CALML4Q96GE6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CALML4Q96GE6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms