Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IMP4Q96G21 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IMP4Q96G21 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IMP4Q96G21 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IMP4Q96G21 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IMP4Q96G21 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IMP4Q96G21 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms